Исследование физиологии диатомей проводится преимущественно в последнее время и пока касается немногих видов, поэтому сущность многих физиологических процессов недостаточно выяснена. На основании имеющихся данных можно заключить, что физиологические процессы аналогичны не у всех диатомей. Отрывочные краткие сведения о физиологии диатомей приведены у Луин и Гийяра (Lewin, Guillard, 1963).