Основной жизненной средой литофильных водорослей служит окружающий их непрозрачный плотный известковый субстрат. Типичные местообитания - в глубине твердых пород определенного химического состава, окруженных воздухом или погруженных в воду. В зависимости от физиологических особенностей относящихся сюда водорослей, различают две группы литофильных сообществ: сверлящие водоросли, активно внедряющиеся в каменистый субстрат и заселяющие мелкие ходы и поры, проделанные ими в каменистой породе, с помощью которых они сообщаются с окружающей средой; туфообразующие водоросли, отлагающие вокруг своего тела известь и обитающие в периферических слоях отлагаемой ими среды, в пределах, доступных для диффузии света и воды. По мере нарастания отложений эти ценозы постепенно отмирают.
Приведенную классификацию можно применять при проведении специальных исследований водорослей вневодных местообитаний, она также служит ориентировочной схемой при комплексных фитоценологических исследованиях, когда возникает необходимость в общих экологических характеристиках водорослей, обнаруживаемых в исследуемом растительном ценозе. При проведении флористических исследований обычно применяют более общие классификации, например, водоросли вневодных местообитаний делят на 4 экологические группировки: 1) воздушные водоросли (аэрофитон); 2) наземные водоросли (геофитон); 3) почвенные водоросли (эдафон) и 4) водоросли внутри известкового субстрата (эндолитофитон) [83]. В зарубежных работах все многообразие вневодных поселений водорослей относят обычно к двум типам: аэрофильные водоросли и почвенные водоросли, причем разрастания водорослей на почве относят либо к первому [417], либо ко второму [651] типу.