Территория юга европейской части Советского Союза принадлежит к восточной части Средиземноморской палеобиогеографической области. В неогеновый период здесь происходили интенсивные движения земной коры. Они сопровождались трансгрессиями и регрессиями вод, заливавших котловины Черноморского и Каспийского бассейнов. Палеогеографическая обстановка, в которой развивалась неогеновая диатомовая флора, сильно изменялась не только во времени, но и в разных частях одного и того же моря. Разнообразие физико-химических условий в разные отрезки времени и в различных частях акваторий обусловило богатство видового состава и разнообразие сообществ морских диатомей в неогене.
В настоящее время известно большое количество местонахождений миоценовых, преимущественно позднемиоценовых, диатомей, в ряде пунктов они изучены детально. Сведений о плиоценовых диатомеях этой области значительно меньше.