В поздненеогеновое время территория Закавказья представляла собой область интенсивной вулканической деятельности. Огромные количества минеральных солей поставлялись в озера, и создавались условия, благоприятствующие массовой диатомовой продукции, так как воды содержали все необходимые питательные вещества и в изобилии кремнекислоту. Диатомиты накапливались в крупных озерах с пелагической областью и в мелких водоемах, где нередко развивалась монотипная флора диатомей.
Диатомиты и диатомовые илы свидетельствуют об очень богатом развитии диатомей в озерах - одна из особенностей осадконакопления Закавказья в плиоцен-плейстоценовое время.
В стратиграфической схеме, предложенной A. Л. Тахтаджяном и А. А. Габриеляном (1948), дана классификация диатомитов Закавказья и их датировка по остаткам высшей растительности. К раннему плейстоцену отнесены диатомиты Сисианского р-на - вблизи сел Сисиан, Шамб, Дарабас, Уз, где известны самые крупные залежи диатомитов Армении. По данным А. А. Габриеляна (1964), мощность осадков, образующих диатомовую свиту Сисианского р-на, местами достигает 400 м. В диатомите вблизи с. Сисиан в комплексе диатомей господствуют Cyclotella comta, C. ocellata, C. aff. temperei и Stephanodiscus astraea var. minutulus. В верхней части разреза Cyclotella aff. temperei вытесняет почти все другие диатомеи и становится породообразующей. В диатомите у с. Уз характерным видом является Stephanodiscus kanitzii (Головенкина, 1967), вероятно местный вид, несколько отличный от типичного S. kanitzii. (Табл. LXXVII).
Близким аналогом сисианской флоры является диатомовая флора в отложениях древнего озера вблизи Ленинакана, в истории которого известны многократные вулканические извержения, отразившиеся в чередовании озерных и вулканогенных материалов. Состав диатомей в ленинаканских озерных осадках, частично сложенных диатомитами, нам представляется очень типичным для раннеплейстоценовых комплексов во внеледниковых районах. Поэтому хотелось бы подробнее остановиться на этом местонахождении, тем более что диатомеи этого крупного древнего озера исследуются в настоящее время в связи с изучением геологической истории района. Отложения древнего ленинаканского озера залегают в Ширакской котловине, на северо-западе Армянской ССР. Они были вскрыты рядом скважин в среднем течении р. Ахуряна. Кроме того, озерные отложения выходят в обнажении у с. Арапи, на правом берегу р. Ахуряна. 10. В. Саядян (1968, 1969) выделяет в отложениях, заполняющих Ширакскую котловину, три пачки общей мощностью в 300 м: 1) нижнюю, представленную озерно-речными осадками, 2) среднюю - с озерными осадками и в том числе диатомовыми глинами и 3) верхнюю - с озерно-речными осадками с галечниками, песками, алевролитами, перемежающимися с вулканическим туфом. Озерные и озерно-аллювиальные отложения перекрываются толщей галечников, в которых найдены кости млекопитающих, в частности Megaloceros sp., указывающие на возможность синхронизации ленинаканских отложений с бакинским ярусом или с окским оледенением.
Диатомовые илы накапливались за счет обильного развития в поверхностных водах озера планктонных диатомей. Они поступали на дно в массовых количествах и отличались хорошей сохранностью. В ленинаканских диатомитах мелких створок Melosira насчитывается до 1 млрд в 1 г осадка, а крупных створок Stephanodiscus niagarae, S. astraea и Cyclotella aff. temperei - до 100 млн (Жузе, 1966a). Флору диатомей в ленинаканском древнем озере, по предварительным данным Н. Г. Заикиной (Заикина и др., 1969), характеризует следующий комплекс: Stephanodiscus astraea var. astraea, var. minutulus et var. intermedius, S. niagarae, Cyclotella aff. temperei, C. ocellata, C. operculata var. operculata et var. unipunctata, C. kuetzingiana var. radiosa, C. comta, Melosira granulata, Tabellaria fenestrata, Fragilaria bicapitata (список насчитывает всего около 50 видов). В массе встречаются все формы Stephanodiscus и Cyclotella aff. temperei. На долю планктонных видов диатомей в составе комплекса приходится 23%. В обнажении у с. Арапи диатомеи приурочены главным образом к нижней части разреза, к диатомовым и оливково-зеленоватым глинам, залегающим на глубине 92-58 м от кровли обнажения. В комплексе диатомей наряду с планктонными присутствуют бентосные виды: Melosira scabrosat Cocconeis disculus, Diploneis elliptica var. elliptica et var. ladogensis, Cymatopleura elliptica, Campylodiscus noricus, Navicula gastrum, N. scutelloides, т. е. виды, населяющие мелководья крупных озер олиготрофного типа. Сочетание таких видов, как Stephanodiscus niagarae, S. astraea var. intermedius et var. minutulus, Melosira scabrosa, Cyclotella aff. temperei, вначале послужило основанием для заключения о позднеплиоценовом возрасте ленинаканского комплекса (Жузе, 1966а, 19666).
Специфической особенностью флоры древнеозерных отложений Армянской ССР (позднеплиоценовой-раннеплейстоценовой) является Cyclotella aff. temperei. В целом ряде пунктов C. aff. temperei встречается в массовых количествах, нередко породообразующих (Порецкий, 19536; Головенкина, 1967). В озерах раннего плейстоцена Армянской ССР сохранились не только C. aff. temperei, но и многие другие позднеплиоценовые виды. В этом заключается наиболее существенная особенность древнеплейстоценовых комплексов армянской, а также камчатской флор. Она определялась как возрастными, так несомненно и экологическими условиями больших глубоководных водоемов горного типа. В ленинаканском комплексе преобладают южно-бореальные виды, а в камчатском - северо-бореальные. Очень показательно отсутствие в ленинаканском комплексе видов рода Eunotia, типичных представителей населения северных водоемов, а в комплексе "синих глин" Eunotia представлены 19 видами. В том же плане следует рассматривать отсутствие в ленинаканском комплексе Achnanthes, характерных для флоры "синих глин". Однако при всем кажущемся большом различии видового состава имеется ярко заметное сходство в составе доминантной группы.